À la fin de l’année 2023, le premier médicament approuvé par la Federal Drug Administration des États-Unis pour ralentir la progression de la maladie d’Alzheimer a été annoncé. Bien que cette avancée représente un pas en avant, il reste encore beaucoup à apprendre sur cette maladie et d’autres troubles neurologiques similaires qui affectent une grande partie de la population mondiale.
La complexité du fonctionnement du cerveau humain au niveau cellulaire constitue l’un des défis majeurs des neurosciences. Pour mieux comprendre les maladies neurologiques, il est essentiel de disposer d’atlas cérébraux en réseau à haute résolution. Cependant, la visualisation et le traitement de vastes ensembles de données d’imagerie cérébrale restent un défi en raison du manque d’outils adaptés.
C’est dans ce contexte que le projet NeuroTrALE a été développé. Ce pipeline logiciel combine l’apprentissage automatique, le supercalcul et une interface conviviale pour faciliter la cartographie cérébrale. En utilisant une technique d’apprentissage actif, NeuroTrALE permet aux chercheurs de traiter de grandes quantités de données d’imagerie cérébrale de manière plus rapide et précise, en automatisant une partie du processus tout en permettant une correction manuelle des erreurs.
En réduisant considérablement le temps de traitement des données, NeuroTrALE offre la possibilité d’explorer davantage de données en moins de temps. Les chercheurs ont constaté une diminution significative du temps nécessaire pour traiter de grandes quantités de données, ce qui ouvre de nouvelles perspectives pour l’étude des maladies cérébrales à l’échelle de la population.
Le projet NeuroTrALE est le fruit d’une collaboration entre le laboratoire Lincoln du MIT et le laboratoire du professeur Kwanghun Chung. Grâce au financement du Lincoln Laboratory et des National Institutes of Health (NIH), NeuroTrALE continue d’évoluer et de s’améliorer. L’objectif est de rendre cet outil entièrement open source et accessible à tous, pour favoriser la collaboration et la recherche dans le domaine des neurosciences.
En intégrant des outils d’interface utilisateur avec des programmes de visualisation open source tels que Neuroglancer, NeuroTrALE offre une solution complète et flexible pour l’analyse et la cartographie cérébrale. En partageant les bases de code et en encourageant la collaboration, l’équipe derrière NeuroTrALE vise à contribuer à la cartographie complète du cerveau humain et au développement de nouvelles avancées médicales.
En savoir plus : https://news.mit.edu/2024/new-open-source-tool-helps-detangle-brain-0814
